在邪神加坦杰厄和迪迦奥特曼的决战结束后，人类世界迎来了长达两年的和平岁月。这一日，入间队长随同GUTS考古队来到位于南太平洋的远古遗迹露露耶，他们再次发现了业已毁灭的超古代城市以及三尊邪神的石像希特拉

一个美国生物学家偷偷把珍贵的亚马逊银龙鱼带入日本，该鱼肚子里被植入了更珍贵的红龙鱼的卵巢。中途龙鱼让某华人团伙盗走，生物学家急忙聘请侦探调查，同时警方也介入了事件的追查之中。侦探社的接线生蒲（芳本美.